Ринат Ралифович Яхин с апреля 2025 года руководил Севзапнедра, ранее занимал должности замначальника Центрсибнедр и замминистра природных ресурсов и лесного хозяйства Красноярского края.
В настоящее время обязанности начальника Севзапнедра исполняет Анна Керова.
Согласно ЕГРЮЛ, с марта 2026 года и.о. начальника Дальнедра являлся Валерий Вологин, который в настоящее время занимает позицию замначальника департамента, начальника Хабаровскнедра.
До этого, с июня 2021 года, главой департамента был Дмитрий Цуканов. По информации прокуратуры Приморья в феврале 2026 года, суд заключил Дмитрия Цуканова и его заместителя Артема Невеселого по делу о взятке в крупном размере.
По данным следствия, с 2021 по 2025 год обвиняемый на системной основе сообщал представителю коммерческой организации служебные сведения, ставшие ему известными в связи с занимаемой должностью. Кроме того, чиновник организовал выдачу этой организации лицензии на пользование недрами с целью разведки и добычи полезных ископаемых на участке в Магаданской области на заведомо выгодных для коммерческой структуры условиях.